Shift standard definitions in Makefile needed to compile AMDiS user

programs to a central place in AMDiS directory.

AMDiS/other/include/Makefile_AMDiS.mk

+#
+# standard definition and rules to compile AMDiS user programms
+#
+# ============================================================================
+#                 !!! Do not edit after this line !!!
+# ============================================================================
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+PARMETIS_DIR = $(AMDIS_DIR)/lib/ParMetis-3.1
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+# ============================================================================
+# ===== includes pathes ======================================================
+# ============================================================================
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+AMDIS_INCLUDE = -I$(AMDIS_DIR)/src -I$(AMDIS_DIR)/compositeFEM/src -I$(AMDIS_DIR)/lib/mtl4
+MPCCI_INCLUDE = -I$(MPCCI_DIR)/include
+PARMETIS_INCLUDE = -I$(PARMETIS_DIR)
+PARALLEL_INCLUDE = -I$(AMDIS_DIR)/src/parallel
+
+INCLUDES = -I. $(AMDIS_INCLUDE) $(MPCCI_INCLUDE) $(PARALLEL_INCLUDE)
+
+# ============================================================================
+# ===== libraries ============================================================
+# ============================================================================
+
+AMDIS_LIB =  -L$(AMDIS_DIR)/lib -lamdis
+PNG_LIB = -lpng
+
+UMFPACK_LIB = -L$(AMDIS_DIR)/lib/AMD/Lib -L$(AMDIS_DIR)/lib/UMFPACK/Lib
+ifeq ($(strip $(USE_SERVER)), mars)
+	UMFPACK_LIB += -lmkl -lumfpack -lamd
+else
+	ifeq ($(strip $(USE_SERVER)), themisto)
+		UMFPACK_LIB += $(MKL_LIB) -lmkl -lguide -lpthread -lumfpack -lamd
+	else	
+		ifeq ($(strip $(USE_SERVER)), deimos)
+			MPI_DIR = /licsoft/libraries/openmpi/1.2.6/64bit
+			UMFPACK_LIB += -lumfpack -lamd -L/licsoft/libraries/goto -lgoto -lpthread
+		else
+			UMFPACK_LIB += -lblas -lumfpack -lamd
+		endif
+	endif
+endif
+
+MPCCI_LIB = -L$(MPCCI_DIR)/lib/linux-x86-glibc22 -lmpcci
+PARMETIS_LIB = -L$(PARMETIS_DIR) -lparmetis -lmetis
+
+LIBS = $(AMDIS_LIB) $(PNG_LIB)
+LIBS += -lboost_iostreams -lboost_filesystem
+
+ifeq ($(strip $(USE_UMFPACK)), 1)
+	LIBS += $(UMFPACK_LIB)
+endif
+
+ifeq ($(strip $(USE_MKL)), 1)
+	ifeq ($(strip $(USE_SERVER)), themisto)
+		LIBS += $(MKL_LIB) 
+	else
+		LIBS += -L$(MKL_LIB) 
+	endif
+
+	LIBS += -lmkl -lmkl_solver -lguide -lpthread
+endif
+
+ifeq ($(strip $(USE_MPCCI)), 1)
+	LIBS += $(MPCCI_LIB) 
+endif
+
+
+# ============================================================================
+# ===== parallel or sequential ? =============================================
+# ============================================================================
+
+ifeq ($(strip $(USE_PARALLEL_AMDIS)), 1)
+	ifeq ($(strip $(USE_SERVER)), mars)
+		ifeq ($(strip $(USE_COMPILER)), gcc)
+			COMPILE = g++
+		else
+			COMPILE = icpc
+		endif
+	else
+		COMPILE = $(MPI_DIR)/bin/mpiCC
+	endif
+
+	LIBS += $(PARMETIS_LIB) -lmpi
+else
+	ifeq ($(strip $(USE_COMPILER)), gcc)
+		COMPILE = g++
+	else
+		COMPILE = icpc
+	endif
+endif
+
+# ============================================================================
+# ===== compile flags ========================================================
+# ============================================================================
+
+ifeq ($(strip $(DEBUG)), 0)
+       CPPFLAGS = -O2
+else
+       CPPFLAGS = -g -O0
+endif
+
+ifeq ($(strip $(USE_OPENMP)), 1)
+	ifeq ($(strip $(USE_COMPILER)), gcc)
+		CPPFLAGS += -fopenmp
+	else
+		CPPFLAGS += -openmp
+	endif
+endif
+
+
+# ============================================================================
+# ===== libtool linking ======================================================
+# ============================================================================
+
+LIBTOOL = $(AMDIS_DIR)/libtool
+LINK = $(LIBTOOL) --mode=link $(COMPILE)
+
+# ============================================================================
+# ===== rules ================================================================
+# ============================================================================
+
+all : 
+	make $(PROGRAMS)
+
+clean: 
+	-rm -rf *.o
+	-rm -rf $(PROGRAMS)
+
+.cc.o: $*.cc
+	$(COMPILE) $(DEFS) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) -c -o $*.o $^ 
+
+
+